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我科學(xué)家開(kāi)發(fā)出具有自主知識產(chǎn)權的基因編輯技術(shù)

2023-06-28 09:21 來(lái)源:光明日報
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(責任編輯:郭文培)
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我科學(xué)家開(kāi)發(fā)出具有自主知識產(chǎn)權的基因編輯技術(shù)

2023年06月28日 09:21   來(lái)源:光明日報   

  光明日報北京6月27日電(記者齊芳)基因編輯技術(shù)是面向未來(lái)的關(guān)鍵技術(shù)之一,能否擁有自主知識產(chǎn)權的基因編輯技術(shù),是這一領(lǐng)域國際競爭的核心。我國科學(xué)家在這一方向又建新功——中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所高彩霞研究組研發(fā)出一系列新的堿基編輯系統,是具有我國自主知識產(chǎn)權的精準基因編輯技術(shù),有望打破堿基編輯底層專(zhuān)利壟斷,將幫助我國在未來(lái)的生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)競爭中處于有利地位。相關(guān)研究成果27日在線(xiàn)發(fā)表于國際學(xué)術(shù)期刊《細胞》。

  蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要承擔者,對蛋白質(zhì)進(jìn)行功能聚類(lèi),是理解其參與的生理過(guò)程、設計新型蛋白質(zhì)等的重要手段。高彩霞介紹:“現有的方法主要基于氨基酸一級序列的相似性對蛋白質(zhì)進(jìn)行聚類(lèi)分析,并以此推斷其功能和演化關(guān)系。然而,蛋白質(zhì)功能由其三維空間結構所決定,開(kāi)發(fā)基于三維結構的高通量蛋白質(zhì)聚類(lèi)方法,將為蛋白質(zhì)功能研究提供更直接、可靠的手段,并推動(dòng)未知蛋白質(zhì)的功能挖掘?!?/p>

  “現有的堿基編輯系統在蛋白質(zhì)研究上有很多局限,而且底層專(zhuān)利由國外持有?!备卟氏颊f(shuō),“由于脫氨酶是堿基編輯系統的核心元件,因此,我們將研究聚焦于挖掘自主知識產(chǎn)權的新型脫氨酶,以開(kāi)發(fā)適用于不同應用場(chǎng)景的新型堿基編輯工具?!?/p>

  研究中,科研人員發(fā)現當蛋白集合的序列同源性較低且功能多樣時(shí),相比于傳統的基于氨基酸一級序列的聚類(lèi)方法,通過(guò)AI輔助的蛋白質(zhì)結構聚類(lèi)能夠得到更準確的結果。因此,該方法能為蛋白質(zhì)功能分析和挖掘提供一個(gè)高效、可靠的新策略。

  研究人員基于進(jìn)一步蛋白質(zhì)結構聚類(lèi)的結果,鑒定到全新的45個(gè)單鏈胞嘧啶脫氨酶(Sdd)和13個(gè)雙鏈胞嘧啶脫氨酶(Ddd),開(kāi)發(fā)了一系列新型堿基編輯系統,并在動(dòng)、植物細胞中進(jìn)行了測試。結果表明,這一新型堿基編輯系統具有更高的編輯活性和編輯效率,突破了現有脫氨酶的應用瓶頸,展現出新型堿基編輯系統在醫學(xué)和農業(yè)方面廣泛的應用前景。

  有評論認為,研究組創(chuàng )新性地運用AI輔助的大規模蛋白結構預測,建立起全新的基于三級結構的高通量蛋白聚類(lèi)方法,實(shí)現了脫氨酶功能結構的深入挖掘,鑒定到完全區別于已知脫氨工具酶的全新底盤(pán)元件,并開(kāi)發(fā)了一系列具有我國自主知識產(chǎn)權的新型堿基編輯工具,為蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。

(責任編輯:郭文培)

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